Dectris EIGER 2 - Page 4

9 TRIGGER AND GATING 20
9.1 Introduction . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 20
9.2 INTS - Internal (Software) Triggering . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 20
9.3 INTE – Internal (Software) Enable . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 21
9.4 EXTS - Externally Triggered Exposure Series . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 22
9.5 EXTE - Externally Enabled Exposure Series . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 23
9.6 EIES - Externally Interrupted Exposure Series . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 24
9.7 EXTG - Externally Gated Exposure . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 25
9.7.1 General Usage . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 26
9.7.2 Second threshold . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 26
9.7.3 Gating Mode ”double” . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 26
9.7.4 Gating Mode ”single” . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 27
10 HDF5 AND ALBULA 29
10.1 ALBULA Overview . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 29
10.2 ALBULA HDF5 Python Library . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 30
10.2.1 Getting Started . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 30
10.2.2 Reading data . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 31
10.2.3 Writing Data . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 32
10.3 Third Party HDF5 Libraries . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 32
11 PIXEL MASK 33
11.1 Applying the pixel mask . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 33
11.2 Updating the pixel mask . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 33
11.2.1 Overview . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 33
11.2.2 Retrieving the current mask from the detector system . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 33
11.2.3 Manipulating the pixel mask . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 33
11.2.4 Uploading and storing the pixel mask . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 34
11.2.5 Python Example . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 34
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