Contents
viii TSQ Endura and TSQ Quantiva Hardware Manual Thermo Scientific
Vacuum Manifold . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 27
Vacuum Gauges . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 27
Vacuum Pumps. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 28
Atmospheric Pressure Ionization Source . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 29
API Source Interface . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 30
Chapter 4 Ion Transmission and Mass Analysis . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .33
Ion Optics. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 33
MP00 Ion Optics . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 34
MP0 Ion Optics . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 35
Mass Analyzers . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 36
Quadrupole Rod Assemblies . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 36
Applied RF and DC Fields . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 37
Mass Analysis . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 39
Collision Cell and CID Efficiency . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 39
Quadrupole Offset Voltage . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 40
Mass Analyzer Lenses. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 40
Dual-Mode, Discrete-Dynode Ion Detection System . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 41
Chapter 5 Syringe Pump and Divert/Inject Valve . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .43
Syringe Pump . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 43
Divert/Inject Valve . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 44
Configurations . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 45
Controlling the Divert/Inject Valve. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 46
Chapter 6 System Shutdown, Startup, and Reset . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .47
Shutting Down the System in an Emergency. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 47
Placing the Mass Spectrometer in Standby Mode . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 48
Turning On the Mass Spectrometer . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 48
Shutting Down the Mass Spectrometer Completely . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 49
Starting the System After a Complete Shutdown. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 50
Starting the LC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 50
Starting the Data System . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 50
Starting the Mass Spectrometer . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 50
Starting the Autosampler. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 51
Resetting the Mass Spectrometer . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 52
Resetting Calibration Parameters. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 52
Restarting the Data System . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 53
On/Off Status for MS Components Under Varying Power Conditions. . . . . . . 53
Chapter 7 Daily Operation . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .55
Before Operating the Mass Spectrometer. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 55
Checking the System Mode. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 56
Checking the Vacuum Pressure Levels. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 56
Checking the Gas Supplies . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 58