Thermo NanoDrop One User Manual

Contents
Thermo Scientific NanoDrop One User Guide v
Measure UV-Vis . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 147
Measure UV-Vis . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 147
UV-Vis Reported Results. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 150
Settings for UV-Vis Measurements . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 152
Measure Kinetics . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 155
Measure Kinetics . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 155
Create Kinetics Method. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 158
Edit Kinetics Method . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 159
Kinetics Reported Results . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 161
Settings for Kinetic Measurements. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 166
Chapter 3 Learning Center . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .175
Micro-Volume Sampling—How it Works. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 176
Set Up the Instrument. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 178
Measure a Micro-Volume Sample . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 193
Measure a Sample Using a Cuvette . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 200
Prepare Samples and Blanks . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 204
Basic Instrument Operations . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 210
NanoDrop One Home Screen. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 211
NanoDrop One Measurement Screens . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 215
NanoDrop One Data Viewer . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 222
NanoDrop One General Operations . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 229
Instrument Settings . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 236
Acclaro Sample Intelligence. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 240
NanoDrop One Viewer Software . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 248
Viewer Home Screen. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 249
Manage Experiments and Associated Data. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 251
Manage Identifiers on a PC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 260
Manage Custom Methods . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 265
Multimedia . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 277
Chapter 4 Maintaining Your Instrument . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .279
Maintenance Schedule. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 280
Cleaning the Touchscreen . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 281
Maintaining the Pedestals . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 282
Cleaning the Pedestals . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 282
Reconditioning the Pedestals . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 285
Decontaminating the Instrument . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 287
Maintaining the Cuvette Sampling System . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 290
Instrument Diagnostics . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 291
Intensity Check . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 291
Performance Verification. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 293
Pedestal Image Check . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 298

Thermo NanoDrop One Specifications

General

Wavelength Range	190-850 nm
Pathlength	1 mm and 0.2 mm (Auto-ranging)
Detection Limit	2 ng/µL (dsDNA)
Light Source	Xenon flash lamp
Maximum Concentration	15, 000 ng/µL (dsDNA)
Detector	2048-element linear silicon CCD array
Measurement Time	< 5 seconds
Weight	2.0 kg (4.4 lbs)
Nucleic Acid Quantitation	Yes
Protein Quantitation	Yes
Display	7-inch capacitive touch screen
Sample Volume	1-2 μL
Absorbance Precision	±0.002 A
Operating Voltage	100 to 240 V AC
Dimensions (W x D x H)	20 cm x 25 cm x 15 cm (8 in. x 10 in. x 6 in.)
Software	Thermo Scientific™ software
Connectivity	USB, Ethernet, Wi-Fi
Operating Temperature	15 - 35°C
Dimensions	20 cm x 25 cm x 15 cm (8 in. x 10 in. x 6 in.)
Absorbance Range	0 - 550 A (10 mm equivalent)