Contents
x TSQ Altis, Quantis, and Fortis Hardware Manual Thermo Scientific
Using the Xcalibur Data System to Acquire Sample Data . . . . . . . . . . . . . . . . . 84
Selecting the External Start Instrument . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 84
Acquiring Data Files with the Xcalibur Data System . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 85
Using Templates in Thermo Xcalibur Instrument Setup . . . . . . . . . . . . . . . . . . 86
Chapter 20 Maintenance Schedule and Supplies. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .87
MS Parts . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 87
Maintenance Schedule. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 88
Guidelines . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 89
Tools and Supplies . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 89
Chapter 21 Maintaining the API Source and Replacing the H-ESI Needle . . . . . . . . . . . . . .93
Cleaning the API Source Housing . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 93
Replacing the H-ESI Needle . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 93
Chapter 22 Maintaining the RF Lens, Exit Lens, MP00 RF Lens, and Lens L0 . . . . . . . . . . . . .95
Removing the API Source Interface. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 95
Removing the RF Lens, Exit Lens, MP00 RF Lens, and Lens L0
(Altis/Quantis) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 97
Removing the Exit Lens, MP00, and Lens L0 (Fortis). . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 99
Cleaning the RF Lens, Exit Lens, MP00, and Lens L0. . . . . . . . . . . . . . . . . . . 100
Reinstalling the API Source Interface. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 101
Chapter 23 Maintaining the API Source Interface . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .103
Performing Source Maintenance Animation . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 103
Removing the Ion Sweep Cone and the Ion Transfer Tube . . . . . . . . . . . . . . . 104
Cleaning the Spray Cone and O-ring . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 107
Cleaning the Ion Transfer Tube . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 108
Cleaning the Ion Sweep Cone . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 108
Chapter 24 Maintaining the Forepumps and the Air Filter. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .111
Maintaining the Forepumps . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 111
Maintaining the Air Filter . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 111
Appendix A Using Basic Tune Functions . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .113
Performing Compound Optimization Animation . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 113
Opening the Tune Window . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 114
Setting the Instrument System Controls . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 115
Setting the Instrument Power Mode . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 116
Checking the Instrument Readback Status . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 117
Setting the Tune Preferences . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 118
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