Contents
viii TSQ Altis, Quantis, and Fortis Hardware Manual Thermo Scientific
MP0 Ion Optics and Beam Blocker. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 24
Dual-Mode, Discrete-Dynode Ion Detection System . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 24
Chapter 7 Controls and Indicators . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .25
LEDs. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 25
Power Entry Module . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 26
Main Power Switch . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 27
Electronics Service Switch . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 27
SV65 Pump Enable Connector . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 27
Communications Panel . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 27
Cooling Fans . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 30
Chapter 8 Using the MS Power Options . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .31
Turning the MS On . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 31
Placing the MS in Standby Mode . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 31
Shutting Down the MS System in an Emergency . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 32
Chapter 9 Shutting the MS System Down Completely . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .33
Shutting the MS Down Completely . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 33
Turning off the LC, Gases, Data System, and Autosampler. . . . . . . . . . . . . . . . 34
Chapter 10 Restarting the MS System After a Shutdown. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .35
Restarting the Data System . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 35
Restarting the Data System Using Windows . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 35
Restarting the Data System Using the Power Button. . . . . . . . . . . . . . . . . . . 35
Resetting the Mass Spectrometer . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 36
Pumping the MS Down . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 37
Resetting Calibration Parameters. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 38
Starting the LC, Gases, and Autosampler . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 39
Chapter 11 MS Components On/Off Status . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .41
Chapter 12 Maintaining the MS on a Daily Basis . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .43
Before Operating the Mass Spectrometer. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 43
Finding and Fixing Air Leaks. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 43
Checking the Vacuum Pressure Levels. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 44
Checking the Argon and Nitrogen Gas Supplies . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 46
After Operating the Mass Spectrometer. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 47
Flushing the Inlet Components . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 47
Purging the Oil in the Forepump . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 48
Emptying the Solvent Waste Container. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 48
Placing the System in Standby Mode. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 48
Chapter 13 Recommended Inlet and Flow Rates. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .49
Guidelines for LC/H-ESI/MS Parameters . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 49
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