TOC - 6
HAPSITE ER Operating Manual
8.7.1.1 Background Subtraction Using a Range of Points . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 8-40
8.7.1.2 Additional Features of the Background Tool . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 8-42
8.7.2 Range Tool. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 8-42
8.7.2.1 Additional Features of the Range Tool. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 8-44
8.8 Displaying Reconstructed Ion Chromatograms (RIC) . . . . . . . . . . . . . . . . 8-44
8.9 Chromatogram Overlay . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 8-49
8.10 Chromatogram Subtract. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 8-52
8.11 Right-Click Menus Within Data Review . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 8-54
8.11.1 Right-Clicking in the TIC Window. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 8-54
8.11.1.1 Properties Menu. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 8-56
8.11.2 Spectrum Window . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 8-57
8.11.3 Analyzing Data Using NIST . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 8-59
8.11.4 NIST Database Program . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 8-60
8.11.5 Grab Spectra for NIST . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 8-61
Chapter 9
Tune
9.1 Introduction to AutoTune and Manual Tune. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 9-1
9.2 AutoTune . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 9-1
9.2.1 Starting AutoTune from the Manual Tune Screen on Laptop Computer . . . 9-1
9.3 Viewing a Tune Report. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 9-3
9.3.1 Tune Reports Options: . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 9-5
9.4 Performing Manual Tune . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 9-7
9.4.1 Manual Tune Variables . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 9-7
9.4.2 Outputs. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 9-8
9.4.3 Inputs . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 9-9
9.4.4 Other Inputs . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 9-12
9.4.5 Set Access Level to Advanced. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 9-13
9.4.6 Manual Tune . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 9-14
9.4.7 Save Tune . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 9-15
9.4.8 Tool Bar . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 9-16
9.4.9 Tune Drop-Down Menu . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 9-17
9.4.10 Tune Control Panel . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 9-20
9.4.10.1 Tune Parameters . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 9-21
9.4.11 Peak Scan Window . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 9-23
9.4.11.1 Peak Scan Window Controls . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 9-23
9.4.12 Setting the Full Scan Range. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 9-24
9.4.13 Tune and Mass Calibration Status . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 9-25
9.4.14 Mass Calibration Status . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 9-26
9.4.15 Scan Window Menu . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 9-27